某机械厂是大型国有企业，因为长期经营管理不善，亏损额达3000万元。2006年11月9日，该厂向人民法院提出破产申

请，并提交了相关的会计报表、债务清单、债权清册等。人民法院经审查决定于11月29日立案。12月25日，人民法院发布公告，通知该厂的债权人于收到通知之日起30日内前来申报债权。2007年4月15日，人民法院召集主持了第一次债权人会议。在此期间，该厂向人民法院申请重整，人民法院经审查认为重整申请符合《破产法》规定，裁定债务人重整，并公告。债务人于2007年5月15日向债权人会议提交重整计划草案。债权人会议只设立了普通债权组，重整计划草案由普通债权组的债权人过半数通过，其中所代表的债权额占该组债权总额的半数，同意该厂进行整顿。管理人向人民法院提出批准重整计划的申请，人民法院裁定批准。在整顿期间，该厂的财务状况继续恶化。2007年8月3日管理人申请终结整顿，人民法院裁定终结对该厂的整顿，宣告其破产。

管理人经讨论提出了破产财产分配方案，将破产财产优先拨付破产费用后，首先清偿了该厂所欠职工工资和劳动保险费用，剩余的破产财产不足以支付该厂所欠的税款和破产债权，管理人决定按比例分配。该破产财产分配方案未经债权人会议讨论，由管理人直接报请人民法院裁定并执行。破产财产分配完毕后，管理人向人民法院提请了终结破产程序，并向该厂原登记机关办理了注销登记。问：该破产还债程序中有哪些违法之处？