甲国某总公司在乙国设立一个分公司，该分公司来源于乙国所得1000万元，乙国的所得税税率为30%。乙国为鼓励外来投资，对该分公司减按15%的税率征收所得税。已知甲、乙两国均实行属人兼属地税收管辖权，甲国与乙国之间签订有税收饶让协定，并对境外所得实行综合抵免限额法，甲同所得税税率为40%。计算该公司在甲国的应纳税额

解析：该公司在乙国按税法规定应纳税额300万元，减按15%税率征税后，实际只缴纳150万元。由于甲乙两国之间签订了税收饶让协定，甲国政府对该总公司征收所得税时，对其分公司在国外缴纳的所得税，不是按实际纳税额150万元进行抵免，而是按税法规定的税率计算的应纳税额300万元给予抵免。
乙国的抵免限额=1000×40%=400（万元）。
来源于乙国的所得可以抵免税额为300万元，在甲国应补税额为：400-300=100（万元）。